厌氧菌感染DNA探针诊断技术

出处:按学科分类—医药、卫生 中国科学技术出版社《临床厌氧菌检验手册》第121页(1694字)

1.材料

(1)地高辛标记脆弱类杆菌DNA探针试剂盒和待检菌株或标本。

(2)硝酸纤维滤膜(NCP膜)、塑料膜、移液器等。

2.检测方法

(1)菌液制备:待检菌液约为106~107CFU/ml,即10~100ngDNA较为合适。

(2)划线点样:在NCP滤膜上划出约1×1cm大小方格,用微量加样器取上述菌液点样,同时用生理盐水点两个空白对照。

(3)干烤:将点样NCP膜夹于双层滤纸中,置烤箱80℃,干烤5~10分钟备用。

(4)变形:将NCP膜置大平皿变形液(试剂盒内配有变形液,或自配0.6MNaOH,1.5MNaCl),室温中处理10~15分钟,取出用滤纸吸干,再至中和液①和②中(中和液①:1.5MNaCl,1MTris,Cl,pH7.5;中和液②:0.6MNaCl,1.5MTris,Cl,pH7.5),分别处理10~15分钟,取出夹于双层滤纸中,至80℃烤箱1.5~2小时,烤干后备用。

(5)预杂交:将上述处理的NCP滤膜装入塑料袋中,加入预杂交液1~3ml(或3~4ml/100cm2),封袋,置42℃振摇4~6小时,开袋回收预杂交液。

振摇前先置100℃,变性10分钟,再置冰浴5分钟,再封袋振摇。

(6)杂交:直接在袋内加入杂交液1~3ml,封袋,42℃振摇过夜,然后回收杂交液(预杂交液及杂交液都在试剂盒中配有,回收的预杂交液和杂交液置-20℃冰箱中,可反复使用)。

(7)洗膜:剪开塑料袋,将NCP膜于平皿内,2×SSC液中室温振摇5分钟,取出置2×SSC/0.1%SDS溶液中67℃漂洗15分钟,又取出置0.2×SSC/0.1%SDS溶液中67℃,再漂洗15分钟。

(8)振摇:将NCP膜小心地移至塑料袋中,加Buffer Ⅱ封袋(2~3ml/100cm2),42℃,振摇40分钟,再回收Buffer Ⅱ液(挤尽塑料袋中液体,-20℃贮存,可反复使用)。

(9)探针标记和洗膜:往塑料袋中加入Anti-Dig-Ap(1:5000in Buffer I),封袋,室温中30~60分钟,再用Buffer I洗膜2次,每次5~10分钟,同时振摇。最后用Buffer Ⅲ洗膜1次,振摇5分钟。再回收Buffer Ⅲ液。

(10)显色:加入显色液NBT4.5μl/ml、BCIP3.5μl/ml和Buffer Ⅲ1ml封袋,避光置室温中4~12小时。

(11)中止反应:将NCP膜置清水中漂洗以中止反应,衬于滤纸上晾干、封袋,可长期保存。

(12)内标对照:每次杂交试验都设内标(阳性)对照。

3.结果观察和记录 阳性为紫色或蓝色斑;阴性为无色。

上述操作为地高辛标记的脆弱类杆菌全菌探针检测方法,操作过程中除了注意阳性和阴性对照试验外,还应注意不在点膜上的假阳性判读。上述方法敏感性为89%,特异性为91.7%,检测灵敏度为104~106CFu/ml细菌或10~100PgDNA。基本上能满足临床检验要求,但开发更敏感的克隆片段的基因探针仍然很有必要。

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